الرسالة الاساسية لمديرية الاقسام الداخلية هو استقبال طلبة المحافظات المقبولين في كليات جامعة  من الدراسات الاولية والعليا، وتقوم بتوفير السكن اللائق لهم مع توفير المستلزمات، وكافة الخدمات الضرورية لراحتهم ورعايتهم... كي يصبحوا كادراً متميزاً قادراً على الابداع والابتكار في العلم، والمعرفة خدمة لعراقنا الموحد الجديد.

تسعى مديرية الاقسام الداخلية/ جامعة الكوفة لتكون من الاقسام الداخلية المتقدمة في العراق، اذ ان المديرية عازمة على جعل الاقسام الداخلية التابعة لها نموذج يقتدى به من قبل الجامعات الاخرى

1- تعمل هذه المديرية جادة من اجل رعاية طلبتها من خلال توفير الجو العلمي والنفسي المناسب لهم
2- تهيئة الكوادر الادارية اللازمة لإدارتها
3- تقوم بمخاطبة الجهات الحكومية والاهلية لدعم هذه المديرية وكذلك للمديرية علاقات بمؤسسات المجتمع المدني هدفها الحصول على الدعم المادي والمعنوي من هذه المؤسسات الى الطلبة الساكنين في هذه الاقسام